イラストレータをしてる友人がPDFに出力してもIllustratorで編集できてしまって困っているという話になり、調べてみたらCS5にセキュリティ設定がありました。(CS4にも設定はあるようです。それ以前のバージョンはわからない。）

Illustratorの[別名で保存]からPDFを選択します。
ここで「Illustratorの編集機能を保持」のチェックを外します。

 

次に左側メニューの中にある「セキュリティ」を選択します。
ここにセキュリティ設定があって、編集する際にパスワードを求めることができます。
「セキュリティと権限の設定変更にパスワードを要求」にチェックし、「権限パスワード」を入力します。
「Acrobat権限」でどこまで許可するのか細かく設定することができるようです。
基本的に権限パスワードを設定していれば、Illustratorで開くことはできないので、これを使えばいいんじゃないかと思います。